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601 人阅读发布时间:2024-08-22 13:45
PCR技术是一种模拟自然DNA复制过程的体外酶促合成特异性核酸片段技术(亦称无细胞分子克隆技术)。它以待扩增的两条DNA链为模板,由一对人工合成的寡核苷酸作为介导,通过DNA聚合酶促反应,在体外进行特异DNA序列扩增。其过程包括模板变性(denature)、引物退火(annealing)和用DNA聚合酶延伸(clongation)退火引物在内的重复循环系列,使末端被引物5’端限定的特异性片段成指数形式累积。由于在每一循环中合成的引物延伸产物可作为下一循环中的模板,因而每次循环中靶DNA的拷贝数几乎呈几何级数增长。因此20次PCR循环将产生约一百万倍(220)的扩增产物,具有操作简单、快速、灵敏度高、特异性强的特点,并且具有从DNA粗制品和降解的DNA模板中扩增靶序列的能力,这一点在生药鉴定应用中尤为重要。
在微量离心管中加入适量缓冲液,加微量模板DNA,四种脱氧单核苷酸(dNTP),耐热Taq聚合酶及两个合成DNA引物,并有Mg2 存在。 随后,轻轻旋紧微量离心管的盖子,以避免反应过程中的任何意外泄露。将离心管置于预热的热循环仪中,设定好特定的温度程序,这是PCR(聚合酶链式反应)的关键步骤。初始阶段,高温变性步骤启动,使得模板DNA的双链解旋成单链,为后续的引物结合提供条件。
紧接着,温度迅速下降至适宜引物退火的温度,此时,两个合成DNA引物特异性地结合到模板DNA的单链上,如同锁与钥匙般精确匹配。这一过程确保了PCR的特异性,即只扩增我们感兴趣的DNA片段。
随着温度再次上升至Taq聚合酶发挥作用的最佳温度,酶开始利用其强大的催化能力,以dNTPs(四种脱氧单核苷酸)为原料,沿着引物延伸,合成与模板DNA互补的新链。这一过程在热循环仪内反复进行,每个循环都使DNA的数量翻倍,直至达到实验所需的扩增水平。
期间,Mg2+作为不可或缺的辅因子,不仅稳定了DNA双链结构,还促进了Taq聚合酶的活性,确保了PCR反应的顺利进行。通过调整Mg2+的浓度,研究人员可以进一步优化PCR的效率与特异性。
经过预定数量的循环后,PCR反应结束。此时,微量离心管中已充满了大量扩增的DNA片段,它们将用于后续的分析、克隆或检测等实验。这一简单而强大的技术,不仅极大地推动了分子生物学领域的发展,也让我们对生命的奥秘有了更深入的探索与理解。
PCR的原理类似于DNA的天然复制过程,关键是运用两个起始引物,分别为待扩增序列的相对的两条单链DNA结合,结合位点分别位于待扩增序列的两端,并且3’端相对,然后利用DNA聚合酶依赖于DNA模板的特性,模仿体内的复制,在两个引物之间诱发聚合酶反应。PCR反应可以简述如下:
1、加热使模板DNA在高温下(95℃左右)变性,双链DNA解开而变成单链DNA游离于溶液中。这是所谓变性阶段。
2、PCR的引物是两段人工合成的寡核苷酸链,长度为16-24个核苷酸残基,其顺序由被扩增的DNA片段两端的序列决定。这两段寡核苷酸链分别与模板DNA的正链和负链互补,所互补的位点一个在被扩增序列的“上游”,一个在被扩增序列的“下游”。高温使模板DNA变性成单链以后,温度降低,由于PCR反应体系中引物的拷贝数远远多于模板DNA的拷贝数,因而引物与模板DNA形成复合物的机率要大大高于模板DNA两条单链的重新结合。只要严格地控制复性的条件,复性过程是倾向于形成引物与模板的复合物的。这是退火阶段。
3、溶液反应温度升至中温(72℃),在Taq酶作用下,以dNTP为原料,引物为复制起点,模板DNA的一条双链在解链和退火之后延伸为两条双链。这是延伸阶段。
如此重复,改变反应温度,即高温变性,低温退火,中温延伸三个阶段。这三次改变温度为一个循环。每循环一次,使特异区段基因拷贝数扩大一倍,一般30次循环,基因放大数可达2n倍。可用公式
Y=(1+X)n
表示,式中Y=DNA扩增倍数,X=扩增效率,循环数为n。
如X=100%,n=20时,Y=1048576倍。但实际扩增效率(X)不会达到100%。
2 试验条件
本程序适用于自动PCR操作,可适用于大多数情况,所用酶是不含核酸外切酶活性的热稳定聚合酶,如Taq聚合酶等。